Vidarに関する総合サイト
アカウントの追加スクリプトは非常に有用でした。現役のRat_gui等は恐らくここから生まれたものでしょうか。
orion氏のサイトと同じく、過去ログを漁りまくった覚えがあります。

古参開発者のhuge氏によるサイト
外部公開時のチェックに使えるserver checker
各種dbを複数人で編集し、常に最新の状態にしているdb編集

そして何よりも、多くのサーバーで使われ続けているserver_data.cgiを始めとした、CGIを多数公開しているサイト。

eAthenaの公式Wiki
構築の解説等も行っており、徐々に項目数が増えてきている。

※2009/09/29 リンク修正

分かりやすい解説で定評のあった、はてな？Athenaの跡地
開発板で継ぎ接ぎだらけの@autolootを実装し、失踪した三郎氏に変わって憂鬱と名乗る人物が管理を引き継いだとあるが、教えて君に耐え切れず閉鎖状態となった不遇のサイト。

BCCとVC++による解説を画像付きで行っているサイト
パッチ鯖の構築解説も行っており、非常に分かり易い。

Athena/Vidarの解説を行っていたブログ
FTPパッチサーバー構築なども扱っており、求めている情報があるかもしれません。

珍しくPrometheusで構築を行い、エミュサーチに登録していたFragmentOnlineの鯖管さんによるブログ。
非常に期待していたのですが、やはりバグが多く駄目だったようです。

Vidarによるエミュ鯖構築をまとめたサイト
僕もエミュ鯖を知った当初、お世話になったサイトです。数少ないVidarの解説サイトで、スクリプト講座等もあり一見の価値有りです。

主にゲームキャラクターのスプライトが置いてある中華サイト
サイコクラッシャーベガ等もあり、非常に面白い内容。

改造スプライトのパッチからツールまで、何でも二次配布しているサイト
データが膨大な為、サーバー公開時にお世話になる方も多いかもしれない。